Pri daljših alkenih (od butena naprej) je možnih več položajev, kjer je lahko dvojna vez. Različni položaji dvojne vezi pomenijo različne spojine z isto molekulsko formulo. V tem primeru govorimo o položajni izomeriji. Položajna izomerija se pojavlja tudi pri alkinih, ki imajo štiri ali več ogljikovih atomov v molekuli.
Pri položajni izomeriji se molekule izomerov razlikujejo po različnem položaju dvojne ali trojne vezi med ogljikovimi atomi v molekuli.
O položajni izomeriji govorimo tudi takrat, ko se v molekulah izomerov spreminja lega atomov drugih elementov ali skupine atomov.