Biološko oziroma ekološko kmetovanje temelji na uporabi izključno naravnih snovi in postopkov pri pridelavi hrane. Gre za načine, ki ne škodujejo okolju, zdravju ljudi, rastlin in živali. Praviloma dovoljuje uporabo le tistih snovi in surovin, ki izvirajo s same kmetije, značilna je uporaba kolobarjenja ter krajevno prilagojenih in zato bolj odpornih rastlinskih in živalskih vrst, dovoljena je uporaba naravnih organskih in rudninskih gnojil (kompost, hlevski gnoj, kamena moka), stalež živine je omejen z velikostjo kmetije (priporočena je obremenitev dveh glav živine na 1 hektar, saj se vsa krma pridela na kmetiji), živina pa mora imeti vseskozi možnost izhoda na prosto.

 

Na drugi strani ekološko kmetovanje prepoveduje uporabo vseh kemičnih sredstev (pesticidi, herbicidi, fungicidi in insekticidi), umetnih gnojil, gensko spremenjenih vrst, ionizirajočega sevanja (uničevanje mikroorganizmov v živilih), krmljenje živine s krmo živalskega izvora, uporabo hormonov, antibiotikov in podobno. Uporaba posameznih preparatov je mogoča le v izjemnih primerih in po predhodnih laboratorijskih analizah.