Med seboj se lahko povezujejo tudi atomi različnih elementov. V
molekulah, ki pri tem nastanejo, so atomi različnih elementov. V ogljikovem
dioksidu so molekule ogljikovega dioksida. V eni molekuli ogljikovega
dioksida sta dva atoma kisika povezana z atomom ogljika. Pri povezovanju
atomov različnih elementov nastanejo spojine. Ogljikov dioksid je
spojina elementov kisika in ogljika. Dva atoma kisika in atom ogljika se povežejo v molekulo ogljikovega dioksida.
V vodi so molekule vode. V eni molekuli vode sta dva atoma vodika povezana z atomom kisika.
Model molekule vode. Rdeča kroglica ponazarja atom kisika, bela kroglica pa atom vodika.